目ヤニの原因を大きく分けると、生理的なもの、感染症によるもの、そして炎症性のものがあります。割合としては猫では感染症が一番多いです。
生理的なものは病気ではありませんので、心配する必要はありません。
感染症は猫ヘルペスウィルスや猫クラミジアなどが特に目ヤニが出やすいです。
それ以外の炎症はアレルギー性の皮膚炎や結膜炎によって起こります。

目の内側（内眼瞼）に涙が溜まって乾いたようにこびりついている茶色の目ヤニは生理的な目ヤニの可能性が高いです（図1）。生理的なものの場合は結膜も赤くなっておらず、目ヤニ以外の症状はありません。

一方で病気が疑われる目ヤニはドロッと粘性があり、青っぱなのような色をしています。それ以外にも結膜が赤くなっていたり、角膜が傷ついている、目を半分つぶるなどの症状を併発していることが多いです（図2）。

基本的には目ヤニの原因を治療することです。細菌による感染症であれば抗生物質の点眼を使います。
ヘルペスウィルスのような一部の感染症は持続感染といって、完全に治癒することができないこともあります。その場合は目の周囲を清潔に保つために無理のない範囲で取ってあげると良いでしょう。乾燥しているものは、ぬるま湯につけたタオルを使うと取りやすいでしょう。
生理的な目ヤニの場合は個体差が大きく、全くつかない猫から毎日つく猫もいます。生理的な目ヤニもできないようにするのは困難です。

上記のようにぬるま湯につけたタオルを使って拭きとると良いでしょう。ふやかすようにじっくりと目に当て、優しく拭いてあげましょう。嫌がる場合は別のタオルで体を巻いて動きを制限したり、おやつをあげながら行うと良いでしょう。
しかし特に炎症が強い場合は、猫が痛がって拭かせてくれないかもしれません。その場合は目を傷つける可能性があるので、無理に拭き取る必要はありません。
目の周囲の洗浄も治療の一環なので、動物病院できれいにしてもらいましょう。